Флаг Шуберского сельского поселения создан на основе герба Шуберского сельского поселения и языком символов и аллегорий отражает исторические и природные особенности Шуберского сельского поселения Новоусманского муниципального района Воронежской области.
Официальное описание флага Шуберского сельского поселения
«Прямоугольное двухстороннее полотнище зелёного цвета с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль нижнего края волнистую полосу белого цвета максимальной шириной 1/4 ширины полотнища. В центре полотнища из волнистой полосы возникает жёлтая ветка дуба из трёх листьев, меж которыми - два жёлудя, при этом средний лист украшен зелёной веткой клюквы с четырьмя красными ягодами (фигуры из герба Шуберского сельского поселения)»

Флаг Шуберского сельского поселения утверждён решением Совета народных депутатов Шуберского сельского поселения Новоусманского муниципального района Воронежской области от 16 июля 2018 года за №149.
Направлен на регистрацию в июле 2018 года для внесения в Государственный геральдический регистр Российской Федерации.
Внесён в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под №11983.
Протокол Государственной регистрации №89 от 05 октября 2018 года (город Санкт Петербург).
Флаг Шуберского сельского поселения внесён в регистр геральдической комиссии при губернаторе Воронежской области в августе 2018 года под №210.
Раскрытие символики флага Шуберского сельского поселения
Шуберское сельское поселение с административным центров в посёлке Шуберское расположено в 18 километрах от города Воронеж. Большую часть территории занимают леса, так что все посёлки, входящие в его состав, со всех сторон окружены лесами.
Символика флага Шуберского сельского поселения многозначна. Зелёное поле щита символически отражает многочисленные лесные угодья, знаменитые шуберские леса, лесничества, кордоны. Волнистая оконечность щита - аллегорически символизирует озёра и другие водные объекты на территории поселения. Волнистая оконечность повторяет оконечность в гербе Новоусманского муниципального района, символизируя этим принадлежность сельского поселении Шуберского конкретному району. Три дубовых листа с желудями - аллегория трёх знаменитых в поселении 300-летних дубов «Святогор», а наличие желудей - символ того, что поселение имеет древнюю, «зрелую», историю. Веточки клюквы - символ богатства местных лесов дикоросами: лесными ягодами, орехами, грибами. Каждая из 4-х ягод клюквы - символизирует один из поселков составляющих единое сельское поселение.
Жёлтый цвет - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая. Белый цвет - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения. Зелёный цвет - символизирует весну, здоровье, природу, молодость и надежду. Красный цвет - символ труда, праздника, красоты, энергии.
Авторская группа
Идея флага: Юрий Владимирович Коржик (город Воронеж).
Обоснование символики: Юрий Владимирович Коржик (город Воронеж).
Художник и компьютерный дизайн: