Центр - город Купянск, преобразованный из городка Купенки (основан в 1655 году).

Купянский уезд создан в ходе губернской реформы 1779 года. Купянский уезд граничил с уездами Екатеринославской губернии и Харьковской губернии. Находился на крайнем юго-западе Воронежской губернии.

Население в середине 1780-х годов - около 50 000 человек. Наиболее крупные насёленные пункты - слобода Каменка, слобода Сенкова, слобода Радьковка, слобода Сватовая Лучка, слобода Ямполе, село Великий Бурлук.

В 1797 году Купянский уезд передан в состав Слободско-Украинской губернии.

Ныне входит в состав Харьковской области (Украина). Город Купянск районный центр, крупный железнодорожный узел.