Флаг Аннинского муниципального района создан на основе герба Аннинского муниципального района и языком символов и аллегорий отражает исторические и природные особенности Аннинского муниципального района Воронежской области.
Официальное описание флага Аннинского муниципального района
«Прямоугольное белое полотнище с отношением ширины к длине 2:3, несущее вдоль нижнего края две полосы - жёлтую в 1/4 ширины полотнища, сплошь покрытую орнаментом в виде стилизованной нивы (вплотную к краю) и зелёную 1/30 ширины полотнища, а в центре вплотную к зелёной полосе - голубое с жёлтым изображение церковного купола»

Флаг Аннинского муниципального района утверждён решением Совета народных депутатов Аннинского муниципального района Воронежской области от 02 августа 2007 года за №12.
Направлен на регистрацию в августе 2007 года для внесения в Государственный геральдический регистр Российской Федерации.
Внесён в Государственный геральдический регистр Российской Федерации под №3555.
Протокол Государственной регистрации №39 от 09 ноября 2007 года (город Санкт-Петербург).
Флаг Аннинского муниципального района внесён в регистр геральдической комиссии при губернаторе Воронежской области в ноябре 2007 года под №66.
Раскрытие символики флага Аннинского муниципального района
В настоящее время Аннинский муниципальный район - один из крупных сельскохозяйственных районов Воронежской области, а в районном центре - посёлке городского типа Анна - сосредоточены крупные предприятия перерабатывающей промышленности. Климат и мощные чернозёмы определили основное занятие жителей района: хлебопашество и животноводство. Традиционным направлением в растениеводстве является выращивание зерновых культур, сахарной свеклы и подсолнечника, в животноводстве - крупнорогатого скота и свиней.
О развитом сельскохозяйственном производстве говорит оконечность герба, выстланная жёлтыми колосьями. Жёлтые колосья - символ роста, обновления и развития, благополучия, богатства. Церковная главка символизирует Христо-Рождественский храм, расположенный в посёлке Анна, и является символом веры и духовности.
Жёлтый цвет - символ богатства, уважения, интеллекта, стабильности. Белый цвет - символ мира, взаимопонимания, чистоты. Зелёный цвет - символ радости, жизни, изобилия, возрождения, природы и плодородия, а также здоровья. Синий цвет - символ возвышенных устремлений, мышления, искренности и добродетели.
Авторская группа
Идея флага: Сергей Иванович Афанасьев (посёлок городского типа Анна), Константин Фёдорович Мочёнов (город Химки).
Обоснование символики: Юрий Владимирович Коржик (город Воронеж).
Художник и компьютерный дизайн: Оксана Григорьевна Афанасьева (город Москва).
[lightbox src="/" width="200" height="142" lightbox="on" style="border" title="Свидетельство" align="left"]